組織搗碎機當轉子高速旋轉時,空氣摩擦生熱,轉子溫度會上升,試管中的樣品溫度也會升高。由于生物學樣品對溫度敏感。一般要求離心實驗中溫度保持4℃。沒有電腦控制的智能化技術,是不可能做到±1℃的精度。因此,用制冷機對離心腔冷卻,而達到冷卻轉子、冷卻樣品溫度的目的。但測量旋轉中的轉子的實際溫度極為困難,國內外都采用在離心腔底部離轉子較近處理設溫度傳感器,間接測量轉子溫度。這里T樣品=T腔+T補償。T補償又與轉子的類別、轉速及運行時間有關。

　　組織搗碎機是由電機帶轉子高速旋轉的。過去的電機是帶碳刷的直流電機,離心機運轉時碳刷磨損,帶來火花與噪聲甚至振動,且有壽命,屆時要更換碳刷再行運轉。更嚴重的是碳刷的磨損帶來碳粉塵的污染,不僅污染離心機,還會污染周圍環境,這種污染對衛生行業是不合適的。

　　模擬技術典型的表現形式為擰旋鈕選擇操作參數(如轉速、溫度與時間等),以表盤的指針來顯示數據。其缺點為:選擇參數與數據的讀數值受操作人與讀數人的人為干擾多,控制精度差。而且每次操作都要這樣,重復性差。有的組織搗碎機雖數字顯示(如旋鈕選值而數字顯示),雖在讀數上有改進,但取值原理未變仍屬模擬技術;數字顯示典型的表現形式為界面友好、鍵盤操作、數字化顯示、可編程操作的全電腦控制,其核心為智能化控制,是由電腦來實現的。組織搗碎機操作所需要一切參數(如轉速、溫度、時間、加減速率檔等),鍵盤操作輸入,并以數字顯示出來,因此選擇操作參數與讀取數誤差極小。又由于是可編程操作,可把一組操作參數編成號碼,可存取使用。

　　組織搗碎機的破碎方法很多，有機械方法、物理方法、化學方法和生物化學方法等。在破碎前，材料常需要預處理，如動物材料要除去與實驗無關甚至有妨礙的結締組織，脂肪組織和血污等，植物種子需要除殼，微生物材料需將菌體和發酵液成分分開等。組織搗碎機不同實驗規模、不同實驗材料和實驗要求，使用的破碎方法和條件也不同。一些堅韌組織，如肌肉、植物的根莖等，常需要強烈的攪拌或研磨作用，才能把其組織細胞破壞。而比較柔軟的組織如肝、腦等，用普通的玻璃勻漿器即可達到*破壞細胞的目的。對同一實驗材料，由于實驗目的（要求）的不同，采用的破碎方式也存在一定差異，如提取中的核酸和提取其中的核苷酸，前者必須保持十分溫和的條件，以保持分子的完整性；組織搗碎機后者可采用強烈手段。